甲烷单加氧酶中组分D-orfY的发现与功能和定点突变实验及分子生物学研究
化学先生 / 2019-07-29
1:甲烷单加氧酶中组分D-orfY的发现
在第一个甲烷单加氧酶的基因序列测定中,就发现在整个基因序列申有一个小的开放阅读框,编码为orfY,但迄今尚未从甲烷氧化细菌中分离出该蛋白,对它的功能也不清楚。该基因位于mmoZ与mmoC之间,分子量约12kDa,称为MMOD,如图2-2所示。Merkx 对这个位于mmoZ与mmoC之间,功能未知的片断orfY,在E.coli 中进行了克隆表达,获得了纯的MMOD蛋白,通过WestenBolt分析,在Bath中确有MMOD存在。一个可能的解释是该蛋白组装在MMO双铁核中心内,其功能是通过MMOD与MMOH结合,对MMO的活性进行调节,如对丙烯环氧化反应有一定的抑制作用,即MMOD有抑制MMO活性的功能。将二倍的MMOD添加到MMOH中,可使MMOH的UV光谱发生明显变化,证明了该蛋白有可能组装在MMOH双核铁中心内。
2:甲烷单加氧酶的定点突变实验
2002年,Callaghan[57]等发表了 针对组分B的不稳定性原位突变试验结果。他们发现,由于组分B的N端12个氨基酸水解,造成了MMO的失活,其中最敏感的氨基酸残基是Ser4-Tyr7.当这些氨基酸残基被突变后,水解速度明显降低,组分B的稳定性提高;当这些氨基酸残基被去除后,发现对MMO的活性产生很大影响;说明这些氨基酸残基对MMO的活性和组分B的稳定性是必需的。使这些必需的氨基酸发生水解的原因,可能是组分B内在的亲质子活性,而在培养基中添加Cu2+之后,可使sMMO失活,但并未抑制组分B的水解。Brandstetter 对Bath菌的MMOB进行突变发现,在组分B的N端,Serl-Ala25 是不稳定的,易发生水解,因此他们将Gly10突变为Ala, Gly13突变为GIn, Gly16 突变为Ala,结果水解被抑制。在这一工作中,他们使用pkk223-3质粒和E.coliJM105宿主,pET-15b 质粒和E. coli BL21宿主进行突变体的表达。
3:颗粒性甲烷单加氧酶的分子生物学研究
对Bath菌的pMMO基因序列也有人进行了基因测序和克隆表达,发现三个亚基是pMOC、pMOA和pMOB,其基因序列与固氮菌中的氨单加氧酶基因序列非常相似,这说明它们在进化中是密切相关的。Mtrichos porium OB3b和Methylocystis sp. M的全部pMMO基因序列已被克隆,它们由2个相同的单体组成,与氨单加氧酶序列的相似性相当高,有42% ~ 87%的基因序列同一性和58%~95%的氨基酸序列同一性。1999年Stolyar将构建的Bath菌染色体插人突变菌株,发现pMOC和pMOA亚基是高度疏水性的,pMOB有2个跨膜区,表现出对E. coli宿主的毒性作用。因此,pMMO在异型宿主中表达可能比较困难,但它的基因序列信息可作为基因探针,用来检测自然界中甲烷氧化菌的存在与多样性。